Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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