Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TWIST1Q15672 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TWIST1Q15672 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms