Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIV2LQ15477 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms