Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP1Q15431 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP1Q15431 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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