Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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PTPRKQ15262 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
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