Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPAQ15257 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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