Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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