Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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