Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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