Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF9Q13886 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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