Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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