Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms