Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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