Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4BQ13620 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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