Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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