Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEUROD1Q13562 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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