Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXE3Q13461 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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