Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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