Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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