Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTK7Q13308 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTK7Q13308 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms