Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms