Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3BQ13214 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms