Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFT88Q13099 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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