Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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