Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BPTFQ12830 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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