Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC15Q0P6D6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC15Q0P6D6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms