Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms