Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms