Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD300CQ08708 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms