Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms