Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNDQ07001 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms