Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBQ06643 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms