Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN1Q04323 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms