Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms