Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYP27A1Q02318 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP27A1Q02318 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms