Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms