Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDR2Q01850 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms