Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEX3Q00994 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEX3Q00994 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BEX3Q00994 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEX3Q00994 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms