Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD1P98174 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD1P98174 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD1P98174 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms