Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX1P83916 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX1P83916 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms