Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX6P78412 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX6P78412 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms