Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB4BP68371 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms