Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P62684 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms