Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms