Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms