Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCCD1P59942 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCCD1P59942 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms