Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDL3P58872 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms