Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms