Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms