Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHBP55084 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HADHBP55084 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HADHBP55084 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms